为加强学校科技工作的顶层设计，提升宏观政策研究水平，增强科技创新和服务社会能力，推动山东省乃至黄淮海区域现代农业发展，经学校研究，决定组建山东农业大学现代农业发展研究院。研究院是学校相对独立、开放型研究机构，是统筹各类研究平台协同创新的组织、设计、指导和协调机构。研究院紧紧围绕现代农业发展面临的重大理论和实际问题，通过组织有关平台的合作，充分发挥学校人才资源、科研条件、科技成果和信息技术等优势，积极开展协同攻关，努力打造成为具有重要影响力的现代农业发展战略研究、创新、咨询和交流平台。

研究院的主要任务是：加强智库建设，强化宏观政策研究，编写研究简报，为政府制定现代农业发展战略等相关政策提供决策参考；加强产学研结合，为涉农企业的发展提供咨询服务；加强项目的顶层设计和超前布局，推进自然科学和社会科学的协调发展；强化协同创新，实现资源共享，提高各类科技平台的建设水平和解决实际问题的能力；搭建学校重大研究成果推介、重大科研选题提报、信息交流和学术活动平台；设立导向性、前瞻性研究方向，提升急需的已有研究方向，鼓励开展“接地气”式的科学研究。

研究院的学术决策机构是学校学术委员会。另聘若干相关专家组成专家委员会，为研究院发展提供咨询。研究院经费从学校教育发展基金中列支，基金提供资金不足部分，由学校学科建设经费补足。经费主要用于导向性招标项目或征集项目的研究、学术交流及研究院的日常运转等。